無(wú)污染：燃料電池對環(huán)境無(wú)污染。它是通過(guò)電化學(xué)反應，而不是采用燃燒（汽、柴油）或儲能（蓄電池）方式－－最典型的傳統后備電源方案。燃燒會(huì )釋放像COx、NOx、SOx氣體和粉塵等污染物。

如上所述，燃料電池只會(huì )產(chǎn)生水和熱。如果氫是通過(guò)可再生能源產(chǎn)生的（光伏電池板、風(fēng)能發(fā)電等），整個(gè)循環(huán)就是徹底的不產(chǎn)生有害物質(zhì)排放的過(guò)程。無(wú)噪聲：燃料電池運行安靜，噪聲大約只有55dB，相當于人們正常交談的水平。這使得燃料電池適合于室內安裝，或是在室外對噪聲有限制的地方。

高效率：燃料電池的發(fā)電效率可以達到50%以上，這是由燃料電池的轉換性質(zhì)決定的，直接將化學(xué)能轉換為電能，不需要經(jīng)過(guò)熱能和機械能（發(fā)電機）的中間變換。